Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Pou4f1P17208 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Pou4f1P17208 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pou4f1P17208 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pou4f1P17208 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pou4f1P17208 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pou4f1P17208 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pou4f1P17208 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pou4f1P17208 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou4f1P17208 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pou4f1P17208 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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