Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmga1P17095 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms