Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabra6P16305 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms