Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmnb1P14733 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms