Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms