Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms