Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd4P10628 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms