Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P10404 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P10404 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P10404 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P10404 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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