Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatspereP0DP43 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms