Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms