Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa6P09092 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa6P09092 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms