Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1P09055 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms