Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc8P09025 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms