Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnfP06804 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnfP06804 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnfP06804 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TnfP06804 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TnfP06804 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TnfP06804 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms