Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PtprcP06800 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprcP06800 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms