Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06330 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06330 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06330 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06330 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06330 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06330 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06330 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06330 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms