Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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H2-Eb1P04230 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb1P04230 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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