Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04213 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04213 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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