Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc1P02468 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamc1P02468 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms