Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P01747 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01747 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01747 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms