Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01653 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01653 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01653 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01653 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01653 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01653 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01653 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01653 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01653 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01653 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms