Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp1O89090 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms