Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopeO89079 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopeO89079 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CopeO89079 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopeO89079 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopeO89079 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopeO89079 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopeO89079 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms