Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc6O88978 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc6O88978 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms