Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnkO88874 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms