Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp2O88623 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp2O88623 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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