Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnal1O88327 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnal1O88327 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnal1O88327 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnal1O88327 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnal1O88327 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms