Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sorl1O88307 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sorl1O88307 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms