Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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