Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1O70583 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1O70583 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1O70583 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1O70583 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1O70583 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms