Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp4O70480 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms