Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtssO70370 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtssO70370 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtssO70370 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtssO70370 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtssO70370 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtssO70370 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtssO70370 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtssO70370 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms