Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna4O70174 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms