Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top3aO70157 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms