Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RngttO55236 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RngttO55236 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RngttO55236 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RngttO55236 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RngttO55236 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RngttO55236 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RngttO55236 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms