Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms