Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ldb2O55203 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ldb2O55203 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ldb2O55203 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb2O55203 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms