Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tlx3O55144 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tlx3O55144 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tlx3O55144 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tlx3O55144 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tlx3O55144 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tlx3O55144 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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