Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms