Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb2O55029 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms