Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Socs5O54928 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms