Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itgb3O54890 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3O54890 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms