Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffaO54786 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffaO54786 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffaO54786 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffaO54786 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DffaO54786 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DffaO54786 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DffaO54786 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DffaO54786 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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