Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms