Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CaluO35887 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CaluO35887 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CaluO35887 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CaluO35887 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms