Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Klf9O35739 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Klf9O35739 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms