Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clk4O35493 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk4O35493 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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