Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atf6bO35451 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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