Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-ObO35424 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-ObO35424 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms