Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srsf5O35326 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srsf5O35326 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms